La palabra Parasitología proviene del griego pará παρά que significa “estudio del que come lo indebido”. Es decir, ya en la antiguedad se tenia nociones de que la infección parasitaria podía deberse a el consumo de alimentos contaminados.
Ya desde varios siglos antes de Cristo la Parasitología era un tema que llamaba la atención de importantes filósofos y médicos griegos como Aristóteles, Galeno y Avicenas, los cuales clasificaron y estudiaron parásitos helmintos tanto del ser humano como de animales.
Con respecto a los parásitos protozoarios, fue necesario el desarrollo del microscopio para poder identificarlos. El primer protozoo descrito fué Balantidium coli, hallazgo realizado por los médicos suizos Stein y Mamsten en el siglo XIX.